Destina-se à formação de professores de Matemática para atuar no ensino fundamental e Médio. 

A primeira turma teve início em março de 2008 com 45 alunos. O projeto do CNLM-UFBA possui algumas diferenças básicas em quando  se trata de metodologia e estrutura: Diferente do curso diurno, o curso noturno possui disciplinas de duração anual ( Cálculo Diferencial e integral, Álgebra linear , e Estruturas algébricas ) e  a possibilidade de exame de qualificação para dispensa destas disciplinas, caso a reprovação anterior não seja por faltas). As disciplinas correspondentes ao Laboratório de Ensino da Matemática, utilizando computadores como ferramenta auxiliar para o ensino  Médio e fundamental, são outras novidades do curso. Embora sofra adaptações  em sua distribuição no fluxograma do curso, todos os conteúdos de matemática abordados  no curso Diurno de Licenciatura em Matemática também o são no curso noturno.